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食品的微波杀菌和保鲜在微波场中，微生物的各种高分子极性基，产生激烈的回转与振动，使蛋白质以及核酸等产生变异，从而杀死细菌。一般情况下，霉菌、酵母和一般细菌加热至70~80℃就能杀死，若用微波1min就能达到杀菌的目的。对于霉菌的孢子，如青霉菌的孢子要在68~71℃经过20min的常规灭菌才能杀死，而用微波在68~71℃经过2min便于得到满意的结果。如用微波对“月饼”进行杀菌、防霉和保鲜，取得了良好效果，再也不用进口的“保鲜剂”。对大豆粉的干燥灭菌、对鸡精的干燥灭菌、对红心地瓜干灭菌等均取得了很好效果。